Primer vajen kanseri çok nadir görülür ve tüm jinekolojik kanserlerin % 2-3’ünü oluşturur. Vajen kanserlerinin % 80-90’ı metastatiktir ve bu metastazlar genellikle endometrium, serviks, vulva, over, rektum ve mesane kaynaklıdır. ABD’de yılda yaklaşık 3000 yeni vajen kanseri ve 900 ölüm vakası bildirilmektedir (16).Histopatoloji epitelyal ve nonepitelyal olmak üzere ikiye ayrılır. Epitelyal tümörlerin % 80 -90’ı skuamöz hücreli kanser ve % 4-10’u adenokanserdir. Vajinal kanserler 60 yaştan sonra görülme sıklığı artar ve 70-80 yaşında pik yapar. Etiyoloji serviks kanseri gibidir. Birden fazla seksüel partner, sigara içimi, alkol kullanımı, erken yaşta ilk cinsel ilişki ve kötü sosyoekonomik düzey vajinal kanserlerde risk faktörüdür. Doğum sayısı ile vajen kanseri arasında bir çok çalışmada hiçbir ilişkiye rastlanmamıştır (17). Geçirilmiş histerektomi, endometriozis, kronik irritasyon, servikal veya vajinal radyoterapi de risk faktörleri arasındadır. Vajinal kanserlerin % 21-76’sında HPV izole edilmiştir. En sık rastlanan tip HPV 16 dır. Etiyolojide herpes simpleks, sifiliz, klamidya gibi seksüel yolla geçen hastalıklar da rol oynamaktadır.
Vajenin nadir görülen kanserlerinden berrak hücreli adenokarsinomun, anne karnında maruz kalınan dietil stilbestrole (DES) bağlı olduğu gösterilmiştir.